(pdf) rapid test for avian influenza detects swine influenza virus
Short CommunicationShort Communication
VeterinaryRecord | November 2, 2021
the concentration of viral particles in the samples (Dugan and others
2008). Thus, sensitivities are higher in samples obtained from sick and
dead animals than samples from apparently healthy animals (Chua
and others 2007, Marche and Van den berg 2010, Sanchez and others
2010). Therefore, influenza virus surveillance from clinically healthy
populations should be taken with caution.
In conclusion, the present study indicates that the rapid-immu—
nomigration test is a rapid and reliable surveillance tool for detection
of influenza viruses in farm and backyard animal populations due to
its sensitivity and specificity. More important, this diagnostic tool is
easy to use, fast and straightforward in field conditions. We believe
this diagnostic assay could be an important tool to perform rapid ani—
mal population screens in regional or national influenza virus surveil-
lance programmes.
Acknowledgements
The authors thank Dr Humberto Ramírez Mendoza (FMVZ-UNAM)
for providing the H1N1 and H3N2 viruses. Also, thanks to Dr Patty
Miller for helping with the English editing of this manuscript.
Funding This project was supported by the Programa de Apoyo a Proyectos de
Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT) IN 202110 from the Universidad
Nacional Autónoma de México (UNAM) and by the SSA/IMSS/ISSSTE/CONACYT
Salud-2009-CO2-126619 project.
Open Access This is an Open Access article distributed in accordance with the
Creative Commons Attribution Non Commercial (CC BY-NC 3.0) license, which
permits others to distribute, remix, adapt, build upon this work non-commercially, and
license their derivative works on different terms, provided the original work is properly
cited and the use is non-commercial. See: http://creativecommons.org/licenses/
by-nc/3.0/
References
CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION. (2012a) Influenza A
(H3N2) variant virus. http://www.shkoda-avto.ru/flu/swineflu/h3n2v-outbreak.htm
CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION. (2012b) Good labora—
tory biosafety influenza virus. http://www.shkoda-avto.ru/h1n1flu/guidelines_labworkers.
htm
CENTERS FOR DISEASE CONTROL AND PREVENTION. (2012c) Prevention and
control of influenza: Recommendations of the Advisory Committee on Immunization
Practices. http://www.shkoda-avto.ru/vaccines/acip/index.html
CHEN, Y., XU, F., GUI, X., YANG, K., WU, X., ZHENG, Q., GE, S., YUAN, Q.,
YEO, A. E., ZHANG, J., GUAN, Y., CHEN, H. & XIA, N. (2010) A rapid test for the
detection of influenza A virus including pandemic influenza A/H1N1 2009. Journal of
Virological Methods167, 100–102
CHUA, T. H., ELLIS, T. M., WONG, C. W., GUAN, Y., GE, S. X., PENG, G.,
LAMICHHANEX, C., MALIADIS, C., TAN, S. W., SELLECK, P. & PARKINSON, J.
(2007) Performance evaluation of five detection tests for avian influenza antigen with
various avian samples. Avian Diseases51, 96–105
DUGAN, V. G., CHEN, R., SPIRO, D. J., SENGAMALAY, N., ZABORSKY, J.,
GHEDIN, E., NOLTING, J., SWAYNE, D. E., RUNSTADLER, J. A., HAPP,
G. M., SEENNE, D. A., WANG, R., SLEMONS, R. D., HOLMES, E. C. &
TAUBENBERGER, J. K. (2008) The evolutionary genetics and emergence of avian
influenza viruses in wild birds. PLoS Pathogens4, e1000076
FACULTAD DE MEDICINA VETERINARIA Y ZOOTECNIA (FMVZ) (2021). Norma
Oficial Mexicana NOM-062-ZOO-1999 Especificaciones técnicas para la producción,
cuidado y uso de los animales de laboratorio. http://www.fmvz.unam.mx/fmvz/
principal/archivos/062ZOOPDF
FELT, S. A., SAAD, M. D & YINGST, S. L. (2008) A multi-species outbreak of highly
pathogenic avian influenza (H5N1) in Grd Jotyar, Iraq: a detailed report. Libian Journal
of Infectious Diseases2, 45–51
LI, Z., WATANABE, T., HATTA, M., WATANABE, S., NANBO, A., OZAWA, M.,
KAKUGAWA, S., SHIMOJIMA, M., YAMADA, S., NEUMANN, G. & KAWAOKA,
Y. (2009) Mutational analysis of conserved amino acids in the influenza A virus nucleo—
protein. Journal of Virology83, 4153–4162
LOTH, L., PRIJONO, W. B., WIBAWA, H. & USMAN, T. B (2008) Evaluation of two
avian influenza type A rapid antigen tests under Indonesian field conditions. Journal of
Veterinary Diagnostic Investigation: Official Publication of the American Association of Veterinary
Laboratory Diagnosticians, Inc20, 642–644
MARCHE, S. & VAN DEN BERG, T. (2010) Evaluation of rapid antigen detection kits
for the diagnosis of highly pathogenic avian influenza H5N1 infection. Avian Diseases
54, 650–654
MORILLA, G. A. & GONZÁLEZ, V. D. (1998) Concordancia entre dos pruebas
(Kappa). In Introducción al Diagnóstico Inmunológico De Las Enfermedades De Los
Animales Domésticos. Ed G. A. Morilla. México, DF: INIFAP-SAGARPA, 34–35
OIE: WORLD ORGANIZATION FOR ANIMAL HEALTH. (2021). Swine Influenza.
http://www.oie.int/fileadmin/Home/eng/Health_standards/tahm/2.08.08_SWINE_
INFLUENZA.pdf
SANCHEZ, M. D. M., CARREON, N. R. & PALACIOS, A. J. M. (2010) Comparison
of two diagnostic methods for the detection of the porcine influenza virus. Veterinary
Mexicana41, 45–58
SHU, L. L., BEAN, W. J. & WEBSTER, R. G. (1993) Analysis of the evolution and vari-
ation of the human influenza A virus nucleoprotein gene from 1933 to 1990. Journal
of Virology67, 2723–2729
SMITH, G. J., VIJAYKRISHNA, D., BAHL, J., LYCETT, S. J., WOROBEY, M., PYBUS,
O. G., MA, S. K., CHEUNG, C. L., RAGHWANI, J., BHATT, S., PEIRIS, J. S., GUAN,
Y. & RAMBAUT, A. (2009) Origins and evolutionary genomics of the 2009 swine-
origin H1N1 influenza A epidemic. Nature459, 1122–1125
SONG, H., Wan, H., ARAYA, Y. & PEREZ, D. R. (2009) Partial direct contact trans—
mission in ferrets of a mallard H7N3 influenza virus with typical avian-like receptor
specificity. Virology Journal6, 126
SPACKMAN, E., PANTIN-JACKWOOD, M. J., SWAYNE, D. E. & SUAREZ, D. L.
(2009) An evaluation of avian influenza diagnostic methods with domestic duck speci-
mens. Avian Diseases53, 276–280
THRUSFIELD, M., ORTEGA, C., DE BLAS, I., NOORDHUIZEN, J. P. & FRANKENA,
K. (2001) WIN EPISCOPE 2.0: improved epidemiological software for veterinary medi—
cine. The Veterinary Record148, 567–572
VIERA, A. J. & GARRET, J. M. (2005) Understanding interobserver agreement: the
Kappa statistic. Family Medicine37, 360–363
WAN, H., SORRELL, E. M., SONG, H., HOSSAIN, M. J., RAMIREZ-NIETO, G.,
MONNE, I., STEVENS, J., CATTOLI, G., CAPUA, I., CHEN, L. M., DONIS,
R. O., BUSCH, J., PAULSON, J. C., BROCKELL, C., WEBBY, R., BLANCO, J.,
AL-NATOUR, M. Q. & PEREZ, D. R. (2008) Replication and transmission of H9N2
influenza viruses in ferrets: evaluation of pandemic potential. PLoS ONE3, e2923
TABLE 1: Comparison of results from three tests for detection
of influenza A virus in nasal swab samples from pigs with or
without signs of respiratory disease
Backyard pigs*
Virus isolation – RT-PCR
‡
Commercial farm pigs
†
Virus isolation – RT-PCR
‡
− Total − Total
Immunomigration 16 7505
−041 410221 221
Total 147 48 5221 226
Sensitivity %100 100
Specificity %87 100
κ value0.45 1
*Backyard pigs without clinical signs
†
Pigs from commercial farms showing respiratory disease signs
‡
Presence of virus was confirmed by isolation and subtype genetic typification by
RT-PCR
RT-PCR, reverse transcription-PCR
group.bmj.com on February 24, 2021 — Published by veterinaryrecord.bmj.comDownloaded from
§
Are all tests the same?
No. The quality of the test depends on the maker, how the test works, and how big a sample of the virus your doctor can collect.
Background
This interim guidance provides an overview of the sensitivities of rapid influenza diagnostic tests (RIDT) in detecting novel influenza A (H1N1) virus in order to help guide the reporting and interpretation of test results. This document does not discuss either direct (DFA) or indirect immunofluorescence assays (IFA).
This guidance is primarily intended for clinical laboratories and clinical practices conducting influenza testing on respiratory specimens from patients with suspected novel influenza A (H1N1) virus infection. Information on laboratory biosafety is available as well as interim guidance on clinical testing recommendations. Guidance will be updated as needed based on new data.
How does the test work?
Your doctor will rub a swab — just like the cotton swabs in your bathroom, but longer — along the back of your throat or up your nose. They’ll seal it in a packet and run a quick test on it themselves, or send it out to a lab.
Rapid influenza diagnostic tests (ridts) | cdc
| These tests provide results in 10-15 minutes and differentiate between influenza A and B | ||||
|---|---|---|---|---|
| Manufacturer | Product | Platform/Instrument | Approved Specimens2 | CLIA Waived3 |
| Abbott | Binax Now Influenza A & B Card 2 | DIGIVALTM | NPS, NS direct | Yes |
| Becton Dickinson & Co. | BD Veritor™ Flu A B | BD Veritor Reader | NPS, NS direct | Yes |
| Becton Dickinson & Co. | BD Veritor™ Flu A B | BD Veritor Plus Analyzer | NPS, NS direct | Yes |
| Quidel Corp. | Sofia® Influenza A B FIA | Sofia FIA Analyzer | NS, NPS, NPA, NPW direct, NP, NPA, NPW in VTM | Yes |
| Quidel Corp. | Sofia® Influenza A B FIA | Sofia 2 FIA Analyzer | NS, NPS, NPA, NPW direct, NP, NPA, NPW in VTM | Yes |
| Quidel Corp. | QuickVue® Influenza A B | N/A | NPS, NS direct | Yes |
| Princeton BioMeditech Corp. | BioSign® Flu A & B LABSCO Advantage Flu A & B LifeSign LLC Status Flu A & B OraSure QuickFlu Rapid A B Polymedco Poly stat Flu A & B Sekisui Diagnostics OSOM® ULTRA Flu A & B Meridian BioScience ImmunoCard STAT Flu A&B McKesson Consult Diagnostics Influenza A&B | N/A | NS, NPS direct (waived) NPA, NPW (not waived) | Yes |
| Becton Dickinson & Co. | BD Veritor™ Flu A B | BD Veritor Reader | NPW, NA, NPS in VTM | No |
| Becton Dickinson & Co. | BD Veritor™ Flu A B | BD Veritor Plus Analyzer | NPW, NA, NPS in VTM | No |
| Remel/Thermo Fisher | XPECT™ Flu A & B | N/A | Nasal wash | No |
| Sekisui Diagnostics, LLC | Acucy Influenza A&B Test | The Acucy System | NPS, NS direct | Yes |
| Sekisui Diagnostics, LLC | OSOM Ultra Plus Flu A&B Test | N/A | NPS, NPA, NPW, NS | Yes |
| Access Bio, Inc. | CareStart Flu A&B Plus | N/A | NPS | No |
- Available FDA cleared tests as of August 2020. List may not include all available test kits approved by the FDA.
- Approved respiratory specimens according to manufacturer’s package insert.
- Ref: http://www.cms.gov/Regulations-and-Guidance/Legislation/CLIA/index.htmlexternal icon
A = aspirate
FDA = U.S. Food and Drug Administration
N = nasal
N/A = RIDT does not use analyzer device
NP = nasopharyngeal
S = swab
VTM = viral transport media
W = wash
Disclaimer: Use of trade names or commercial sources is for identification only and does not imply endorsement by the Centers for Disease Control and Prevention or the Department of Health and Human Services.
Rapid-test sensitivity for novel swine-origin influenza a (h1n1) virus in humans | request pdf
M. E.Wilson, L. H.Chen, P. V.Han, J. S.Keystone, J. P.Cramer, A.Segurado, D.Hale, M.Jensenius, E.Schwartz, F.von Sonnenburg, K.Leder, A.Plier, K.Smith, G.-D.Burchard, R.Anand, S. S.Gelman, K.Kain, A.Boggild, C.Perret, F.Valdivieso, L.Loutan, F.Chappuis, P.Schlagenhauf, R.Weber, R.Steffen, E.Caumes, A.Perignon, M. D.Libman, B.Ward, J. D.Maclean, M. C.Grobusch, A.Goorhuis, P.de Vries, K.Gadroen,
… [Show full abstract] F.Mockenhaupt, G.Harms, P.Parola, F.Simon, J.Delmont, H.Nord, H.Laveran, G.Carosi, F.Castelli, B. A.Connor, P. E.Kozarsky, H.Wu, J.Fairley, C.Franco-Paredes, J.Using, G.Froberg, H. H.Askling, U.Bronner, N. J.Haulman, D.Roesel, E. C.Jong, R.Lopez-Velez, J. A.Perez Molina, J.Torresi, G.Brown, C.Licitra, A.Crespo, A.McCarthy, V.Field, J. D.Cahill, G.McKinley, P. J.van Genderen, E.Gkrania-Klotsas, W. M.Stauffer, P. F.Walker, S.Kanagawa, Y.Kato, Y.Mizunno, M.Shaw, A.Hern, J.Vincelette, D. O.Freedman, S.Anderson, N.Hynes, R. B.Sack, R.McKenzie, T. B.Nutman, A. D.Klion, C.Rapp, O.Aoun, P.Doyle, W.Ghesquiere, L. M.Valdez, H.Siu, N.Tachikawa, H.Kurai, H.Sagara, D. G.Lalloo, N. J.Beeching, A.Gurtman, S.McLellan, E. D.Barnett, S.Hagmann, M.Henry, A. O.Miller, M.Mendelson, P.Vincent, M. W.Lynch, P. T.Hoang Phu, N.Anderson, T.Batchelor, D.Meisch, J.Yates, V.Ansdell, K.Permanente, P.Pandey, R.Pradhan, H.Murphy, F.Basto, C.Abreu. (2021) Illness in Travelers Returned From Brazil: The GeoSentinel Experience and Implications for the 2021 FIFA World Cup and the 2021 Summer Olympics. Clinical Infectious Diseases 58, 1347-1356
CrossRef
R. C.LaRocque, S. R.Rao, J.Lee, V.Ansdell, J. A.Yates, B. S.Schwartz, M.Knouse, J.Cahill, S.Hagmann, J.Vinetz, B. A.Connor, J. A.Goad, A.Oladele, S.Alvarez, W.Stauffer, P.Walker, P.Kozarsky, C.Franco-Paredes, R.Dismukes, J.Rosen, N. A.Hynes, F.Jacquerioz, S.McLellan, D.Hale, T.Sofarelli, D.Schoenfeld, N.Marano, G.Brunette, E. S.Jentes, E.Yanni, M. J.Sotir, E. T.Ryan, . (2021) Global TravEpiNet: A National Consortium of Clinics Providing Care to International Travelers—Analysis of Demographic Characteristics, Travel Destinations, and Pretravel Healthcare of High-Risk US International Travelers, 2009-2021. Clinical Infectious Diseases 54, 455-462
CrossRef
§
Sources
SOURCES:
CDC: «Estimating Seasonal Influenza-Associated Deaths in the United States: CDC Study Confirms Variability of Flu.»
Mayo Clinic: «Bird flu (avian influenza).»
U.S. Department of Health and Human Services: «Inexpensive Test Detects H5N1 Infections Quickly and Accurately.»
National Institute of Allergy and Infectious Diseases: «Flu (Influenza) — Improving the Gold (Bead) Standard for Flu Tests.»
Medscape: «Influenza Resource Center.»
What does a test look for?
It’s checking for the virus. Some tests can help your doctor figure out which flu virus you have, influenza A or B.
Why do you need it?
When your doctor finds the flu virus, they can give you antiviral drugs early on. This is when they work best. If you get diagnosed early — within 48 hours after symptoms show up — these drugs can ease your symptoms and shorten the illness by a day or so. After the first 2 days, though, these meds won’t do much for you.
A flu test can also help your doctor rule out giving you antibiotics. Those don’t work against viral infections like the flu.
Экспресс-тест для совместного выявления гриппа а и в
Тест «РЭД грипп А и В» предназначен для in vitro одноэтапного быстрого качествен-
ного выявления вируса гриппа А и/или вируса гриппа В в респираторных выделениях человека.
КРАТКАЯ ИНФОРМАЦИЯ
Возбудителем гриппа является вирус, который поражает, главным образом, верхние
дыхательные пути – нос, горло, бронхи, реже – легкие. Заболевание обычно длится од- ну-две недели и характеризуется высокой температурой, миалгией, головной болью, не- домоганием, сухим кашлем, болью в горле и ринитом.
Для детей, пожилых людей и людей, страдающих заболеваниями легких, почек, серд- ца, диабетом, раком, грипп представляет серьезную опасность. Эта инфекция может вы- звать осложнения основных заболеваний, пневмонию и смерть. Заболевание человека вызывают, как правило, два типа гриппа – тип А (подтипы H3N2 и H1N1) и тип В. Причиной смертей от гриппа чаще всего является вирус А подтипа H3N2.
ПРИНЦИП МЕТОДА
Определение основано на принципе иммунохроматографического анализа. Анализи-
руемый образец жидкого биологического материала абсорбируется поглощающим участ-
ком тест-полоски. При наличии в образце вируса гриппа А и/или вируса гриппа В они
вступают в реакцию с нанесенными на стартовую зону специфическими моноклональны-
ми антителами против вируса гриппа А и специфическими моноклональными антителами
против вируса гриппа B, меченными окрашенными частицами, и продолжают движение с
током жидкости. В соответствующих аналитических зонах тест-полоски происходит вза-
имодействие со специфическими моноклональными антителами против вируса гриппа А
и/или вируса гриппа В, иммобилизованными на поверхности мембраны, с образованием
окрашенных иммунных комплексов.
В контрольной зоне тест-полоски специфический окрашенный иммунный комплекс
образуется независимо от наличия в тестируемом биологическом материале вируса грип- па А и/или вируса гриппа В.
В том случае, если в анализируемом образце присутствует вирус гриппа А и вирус грип-
па В, на тест-полоске образуются три параллельные окрашенные линии (красная и синяя
аналитические, обозначенные буквой Т, и зеленая контрольная, обозначенная буквой С),
что указывает на положительный результат анализа по вирусам обоих типов. В случае от-
сутствия в анализируемом образце вируса гриппа А и вируса гриппа В на тест-полоске об-
разуется одна зеленая контрольная линия (С), что указывает на отрицательный результат
анализа по вирусам обоих типов.
СОСТАВ
Один комплект тестов «РЭД грипп А и В» включает:
• тест-полоски иммунохроматографические «РЭД грипп А и В» в кассетах
из пластика белого цвета – 5, 10 или 20 шт.;
• флакон с крышкой-капельницей, содержащий буфер для растворения образца –
1 шт.;
• одноразовые пластиковые пробирки – 5, 10 или 20 шт., соответственно;
• стерильные ватные тампоны на зонде – 5, 10 или 20 шт., соответственно;
• одноразовые пластиковые пипетки – 5, 10 или 20 шт., соответственно;
• этикетки на клеевой основе для маркировки пробирок пользователем – 5, 10
или 20 шт., соответственно;
• инструкцию по применению теста «РЭД грипп А и В» – 1 шт.
Кассеты с тест-полосками и одноразовые пластиковые пипетки упакованы в индиви-
дуальные вакуумные упаковки из фольги алюминиевой, содержащие пакетики с силика-
гелем.
Комплект тестов «РЭД грипп А и В» упакован в картонную коробку.
НЕОБХОДИМЫЕ ОБОРУДОВАНИЕ И МАТЕРИАЛЫ,
НЕ ВХОДЯЩИЕ В СОСТАВ НАБОРА
• одноразовые резиновые или пластиковые перчатки;
• часы или таймер.
АНАЛИТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ
• Чувствительность теста «РЭД грипп А и В» составляет >99% по вирусу типа А
и 99% по вирусу типа В.
• Специфичность теста «РЭД грипп А и В» составляет >98% по вирусу типа А и 99%
по вирусу типа В.
• Время проведения анализа – 10 мин.
Каждый тест «РЭД грипп А и В» предназначен для одного определения наличия вируса
гриппа А и/или вируса гриппа В в респираторных выделениях человека.
МЕРЫ ПРЕДОСТОРОЖНОСТИ
Тест «РЭД грипп А и В» предназначен только для in vitro диагностики.
Все компоненты теста «РЭД грипп А и В» в используемых концентрациях являются
нетоксичными.
Не следует использовать тесты «РЭД грипп А и В» после истечения срока годности.
При проведении определения следует надевать одноразовые резиновые или пластико-
вые перчатки, т.к. исследуемые образцы биологического материала следует рассматривать
как потенциально инфицированные.
Использованные тесты и остатки биологического материала должны быть помещены
в специальный контейнер для санитарных отходов.
АНАЛИЗИРУЕМЫЕ ОБРАЗЦЫ
Свежесобранный биологический материал (респираторные выделения из носовой по-
лости человека), не содержащий консерванты.
Образцы респираторных выделений до определения можно хранить при температуре
2–4°С не более 8 ч.
Перед анализом образцы респираторных выделений должны быть доведены
натной температуры.
Conclusions
Our findings illustrate the challenges clinicians face during the current pandemic. Because clinical symptoms of pandemic (H1N1) 2009 are nonspecific, definitive diagnosis requires confirmatory PCR testing, which, when available, often requires several days between specimen collection and reporting of results.
Rapid antigen tests are the only current option for screening and diagnosis at the point of care. Current CDC guidelines recommend that high-risk and hospitalized infected patients be treated promptly with antiviral drugs and managed by using specific infection control precautions (13).
Given the frequency of error found in this study, pandemic (H1N1) 2009 cannot be excluded solely because of a negative rapid antigen test result. Likewise, false-positive results, which would be expected to increase when the prevalence of influenza as a cause of influenza-like illness decreases, may result in unwarranted treatment and infection control measures that can be labor and resource intensive.
Although rapid antigen tests are reported to have high specificity for seasonal influenza, our findings conflict with previous assumptions that rapid antigen tests are sufficiently specific to guide decisions about withholding antiviral treatment or chemoprophylaxis for pandemic (H1N1) 2009 (2).
A difference in swab types between rapid and PCR testing might have affected sensitivity of the rapid test results. Likewise, although influenza B virus was detected in only 9 (0.09%) of 10,367 specimens during the 7.5 months of statewide surveillance, some rapid test results may have been interpreted as falsely positive due to infection with influenza B.
In conclusion, we found the QuickVue influenza test had suboptimal sensitivity and specificity for the detection of pandemic (H1N1) 2009 during a period of increased prevalence in California. This finding suggests that rapid test results that may lead to changes in clinical management or public health intervention should be confirmed with PCR.
A strength of our study is its reflection of typical testing practices in outpatient settings and the need for reconsideration of the clinical application of rapid test results. The development of more accurate point-of-care tests for seasonal and pandemic (H1N1) 2009 infection is urgently needed.
How long does it take to get results?
If your doctor does the test themselves, or they do it in the lab at their office, the answer usually comes back within 15 minutes.
